行政管理系是人文社会科学学院三个实体教研机构之一，成立于1999年，主要承担行政管理专业的专业基础课、专业课、专业选修课的教学任务。自成立以来，行政管理系以民族区域自治地方行政管理和民族区域自治地方人力资源管理为研究方向，以培养适应民族地方行政管理的应用型管理人才为目标，教学、科研、学科建设上突出民族地方特色，在教育教学方面取得了一定的成果，形成了一支结构合理、学术专精的教学团队。行政管理系现有专任教师9人，其中副教授3人，讲师及以下6人；具有博士学位1人，在读博士1人，硕士学位6人，硕士研究生导师1人；使用蒙古语授课教师3人。同时，还与中国人民大学、中央民族大学等建立教学和学术联系。近年来，行政管理系教师共主持和参加国家社科基金项目2项，自治区级哲学社会科学研究项目5项，校哲学社会科学基金项目4项，主编参编出版专著、教材15部，公开发表论文60余篇。  

行政管理系主办的行政管理专业是在前内蒙古农牧学院马列部1996年设置的行政管理与文秘辅修专业的基础上，经过资源整合，于1999年经教育部批准正式设立，并于2000年开始招生，这是我校第一个文科专业，也是我区第一个行政管理专业。2001年开始招收蒙语授课本科生，使本专业成为国内唯一的少数民族语言授课的行政管理专业。本专业学生主要学习行政学、政治学、管理学、法学等方面的基本理论和基本知识，受到行政学理论研究、公共政策分析、社会调查与统计、外语、公文写作和办公自动化等方面的基本训练，具备行政管理的基本能力及科研的初步能力。本专业以人才市场为导向，紧密结合全球经济一体化和政府加强公共管理对相应专业人才的需求，充分利用现有资源，积极创造条件，夯实专业基础，突出专业特色，力争在强化案例教学、提高实务分析以及电子政务实验室的建设和专业资料建设、教师队伍建设、实习基地建设等方面均有新的突破和进展，取得了较为显著的成效。行政管理专业现为校级品牌专业，校级优秀教学团队，承担校级精品课程建设1项，优秀网络课程4项。目前已经建成一定规模的电子政务实验室和多个校外实习、实践基地，对培养理论与实际相结合的实用型人才创造了坚实的条件。